Kunereka kwa molekulini teknolojia maalum ya kutenganisha kioevu-kioevu, ambayo ni tofauti na kunereka kwa jadi ambayo inategemea kanuni ya kutenganisha tofauti ya kiwango cha mchemko. Huu ni mchakato wa kunereka na utakaso wa nyenzo zisizo na joto au nyenzo za kiwango cha juu cha kuchemsha kwa kutumia tofauti katika njia ya bure ya mwendo wa Masi chini ya utupu wa juu. Hasa kutumika katika kemikali, dawa, petrochemical, viungo, plastiki na mafuta na maeneo mengine ya viwanda.
Nyenzo huhamishwa kutoka kwa chombo cha kulisha hadi kwa evaporator kuu ya kunereka iliyotiwa koti. Kupitia mzunguko wa rota na inapokanzwa mara kwa mara, kioevu cha nyenzo husukumwa ndani ya filamu ya kioevu chembamba sana, na kusukumwa chini kwa umbo la ond. Katika mchakato wa kushuka, nyenzo nyepesi (yenye kiwango cha chini cha kuchemsha) kwenye kioevu cha nyenzo huanza kuyeyuka, kuhamia kwenye condenser ya ndani, na kuwa kioevu kinachotiririka hadi kwenye chupa ya kupokea awamu ya mwanga. Nyenzo nzito zaidi (kama vile klorofili, chumvi, sukari, nta, n.k.) haziyeki, badala yake, hutiririka kando ya ukuta wa ndani wa kivukizo kikuu hadi kwenye chupa ya awamu nzito ya kupokea.